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일정한 빛의 파장에 반응하는 물질을 검출하는 검출기이다. 검출하고자 하는 물질이 형광을 띠는 물질이라면 형광을 띨 수 있는 빛의 파장을 가해준다. 그러면 물질은 그 빛에너지를 받아 일정한 빛을 방출하게 되는데, 이 때 나오는 빛을 센서를 통해 검출하는 것이다. 
이 검출기는 매우 선택적으로 사용이 가능하며 간혹 물질 자체가 형광을 띠지 않을 경우 시료전처리를 통해 형광물질을 코팅 해주는 과정을 거치기도 한다.